Nature Biotechnology:人源 AGO2 打造可编程 RNA 编辑靶向结构域 ALTER
一种完全由人源蛋白构建的可编程 RNA 碱基编辑器 ALTER 在 Nature Biotechnology 发表,其用人源 AGO2 替代细菌 CRISPR–Cas 蛋白作为靶向结构域。该设计降低了治疗应用中引发有害免疫反应的关键风险因素,且整体效果优于基于 dCas13 的编辑器。
一种完全由人源蛋白构建的可编程 RNA 碱基编辑器 ALTER 在 Nature Biotechnology 发表,其用人源 AGO2 替代细菌 CRISPR–Cas 蛋白作为靶向结构域。该设计降低了治疗应用中引发有害免疫反应的关键风险因素,且整体效果优于基于 dCas13 的编辑器。
深度学习模型 DynaVelo 利用单细胞多组学数据中 RNA 表达与 TF 基序可及性的联合动力学,预测遗传扰动对细胞命运轨迹的影响。研究将其应用于小鼠生发中心 B 细胞,涵盖野生型及 Arid1a、Ctcf 杂合功能缺失突变三种基因型,模型可从头生成细胞与轨迹、重建动态基因调控网络,并预测功能缺失扰动的影响及可挽救该动力学的 TF 扰动。
Buck Institute 研究科学家 Emma Glass 在 James Yurkovich 实验室开发全细胞模拟软件,用计算模型预测大肠杆菌在不同环境及抗菌药物下的行为,无需培养皿即可算出抑制细菌生长所需抗生素浓度。该工作由 DARPA 资助,同时为 TIME 临床试验提供数据分析,其框架被视为未来模拟人类细胞、理解细胞衰老的蓝图。她预计未来十年将出现首批高保真人类细胞数字模型。
Buck 衰老研究所聘请系统生物学与 AI 专家 Nathan Price 担任教授及人类健康寿命中心联合主任,目标是用人工智能和先进分析将医学从被动“疾病治疗”转向主动健康管理,以预测和预防疾病。
Buck 衰老研究所 AI 平台主任 David Furman 在斯坦福参与发起 1000 Immunomes Project,对 1000 名 9 至 96 岁人群的数千种生物标志物进行分析,部分队列随访长达 13 年,发现免疫衰老与炎症是整体衰老的重要决定因素。
Buck Institute 副教授 David Furman 正在开发一款名为“Healthy Selfie”的手机 App,通过一张面部照片加一份问卷评估炎症水平,无需抽血即可推测生物衰老进程。
Buck Institute 教授 Christopher Benz 认为,癌症研究的未来在于按分子与基因组特征对肿瘤进行亚型分类,而非仅按起源器官划分类型。